Bioinformatics für Dummies

Bioinformatik kombiniert Informationstechnologie und Molekularbiologie, so macht es Sinn, dass das Internet für die Verfolgung der Bioinformatik Informationen die Hauptarena ist. Die folgende Liste bietet Links zu hilfreichen Webseiten auf der ganzen Welt und die Bereiche, die sie spezialisieren sich auf:

Bioinformatik-Websites für die Analyse von DNA / RNA-Sequenzen

Die Bioinformatik-Webseiten in der folgenden Liste bieten Hilfe in Sequenzen von DNA und RNA zu analysieren. Und in der Ehe der Informationstechnologie und der Molekularbiologie, der Bioinformatik ist, ist diese Art der Analyse, was es überhaupt geht.

Bioinformatik-Websites für die Analyse von Proteinsequenzen

Mit der Bioinformatik können Sie Molekularbiologie Informationstechnologie erkunden. Die Links zu den Webseiten in der folgenden Liste Fokus auf Proteinsequenzen. Einige bieten durchsuchbare Datenbanken, andere helfen Sie einen einzelnen Eiweiß- alle nützlich sind zu untersuchen:

  • SPRENGEN: Datenbank-Homologie-Suche

  • SRS: Datenbanksuche

  • Entrez: Datenbanksuche

  • InterProScanFinden Proteindomänen:

  • ExPASyAnalysieren eines Proteins:

  • ClustalW: Mehrere Sequenzabgleich

  • T-KaffeeBewerten Sie mehrere Ausrichtung:

  • Jalview: Mehrere Alignment-Editor

  • PSIPRED: Sekundärstrukturvorhersage

  • Cn3D: Anzeige und Spin-3-D-Strukturen

Bioinformatics Datenformate

Wenn Sie das Internet verwenden mit Bioinformatikdaten Projekt zu helfen, kommen Sie über Daten in allen möglichen verschiedenen Formaten. Die folgende Tabelle kann Ihnen helfen, gemeinsame Bioinformatik-Formate verstehen und was können Sie und können mit ihnen nicht tun.

Format NameBeschreibung
ROHSequenzformat, die keinen Header enthält. Spaces andnumbers sind in der Regel gut vertragen.
FASTADies ist das Standardformat. Sequence-Format, das aheader Linie und die Sequenz enthält: > name
AGCTGTGTGGGTTGGTGGGTT
PIRSequence-Format, das auf FASTA ähnlich ist, aber weniger häufig
Ärzte ohne GrenzenMultiples Sequenz-Alignment-Format
CLUSTALMultiple Sequenz-Alignment-Format (funktioniert mit T-Coffee)
TXTTextformat
GIF, JPEG, PNG, PDFGrafikformate. Verwenden Sie sie nicht Wichtige zu speichern.

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